Verplicht in fase
Optioneel in fase
Eerste semester
Beide semesters
Dit jaar
Volgend jaar
Wisselende jaren
Extern
Voorwaarden
Identieke opleidingsonderdelenGentechnologie (B-TM-Z25945)
Uitgesloten voor examencontract
Rombouts Lieve (coördinator) | Rombouts Lieve | Vleugels Rut | N. Doelstellingen
Theorie gentechnologie
- Je kiest afhankelijk van het organisme (virussen, bacterien, planten en dieren) waarmee je werkt de juiste methode voor DNA/RNA isolatie, DNA opzuivering en DNA modificatie en je legt de principes uit van de verschillende methodes.
- Je legt de verschillende transformatie methodes uit en kan deze met elkaar vergelijken.
- Je legt in eigen woorden uit hoe de in de cursus behandelde merkergenen kunnen gebruikt worden in gentechnologisch onderzoek.
- Je vergelijkt de in de cursus behandelde PCR methodes met elkaar en je kan aangeven in welke omstandigheden welke PCR methode best kan worden gebruikt
- Je vergelijkt de in de cursus behandelde methodes voor de bestudering van het genoom, transcriptoom en proteoom met elkaar
- Je vergelijkt de 1ste, 2de en 3 de generatie sequencingmethodes met elkaar
Bio-informatica
- Je kan informatie opzoeken omtrent DNA, RNA en eiwitten in genetische databanken.
Labo gentechnologie
- Je voert in labomstandigheden gentechnologische basistechnieken zoals DNA-isolatie, transformatie, PCR, elektroforese, blotting, immunodetectie, ELISA... precies uit.
- Je werkt steriel bij de opkweek van micro-organismen
- Je houdt een laboschrift bij op de manier aangegeven in de handleiding
- Je gaat op een professionele manier om met labomateriaal en apparatuur in de labo’s
Begintermen
Aansluitend op doelstellingen van andere OPO’s, die voor het betreffende OPO in het modeltraject staan opgenomen:
- Genetica Z26573
- Toegepaste genetica en microbiologie Z25888
- Biotechnologie Z2593
Voor dit OPO geldt strenge volgtijdelijkheid, voorkennis is vereist. Deze wordt gemotiveerd omwille van mogelijke materiële schade.
Om dit OPO op te nemen dient de student simultaan ingeschreven te zijn voor het OPO Biotechnologie Z2593
Volgtijdelijkheidsvoorwaarden
Je moet voldoen aan een volgtijdelijkheidsvoorwaarde om dit opleidingsonderdeel te mogen opnemen. Volgtijdelijkheid kan STRENG of SOEPEL zijn of een GELIJKTIJDIGHEID inhouden. Ook kan een diplomaNIVEAU als voorwaarde gesteld zijn.
Verklaring:
STRENG: Om dit opleidingsonderdeel op te nemen, moet je geslaagd zijn voor of een tolerantie ingezet hebben voor de opleidingsonderdelen waarvoor dit soort voorwaarde geldt.
SOEPEL: Om dit opleidingsonderdeel op te nemen, moet je de opleidingsonderdelen waarvoor dit soort voorwaarde geldt, gevolgd hebben.
GELIJKTIJDIG: Om dit opleidingsonderdeel op te nemen, moet je ook de opleidingsonderdelen waarvoor dit soort voorwaarde geldt, opnemen of al opgenomen hebben.
NIVEAU: Om dit opleidingsonderdeel op te nemen, moet je ten minste deze graad behaald hebben.
GELIJKTIJDIG(Z25938)
Bovenstaande codes van opleidingsonderdelen stemmen overeen met onderstaande omschrijvingen van die opleidingsonderdelen:
Z25938 : Biotechnologie
Dit opleidingsonderdeel is een voorwaarde voor het opnemen van volgende opleidingsonderdelen:
Z26237 : Biotechnologie en Immunologie van planten
Plaats in het onderwijsaanbod
- Bachelor Agro- en Biotechnologie (Geel) (Keuzetraject Biotechniek) 180 sp.
Onderwijsleeractiviteiten
6 sp. Gentechnologie (B-TM-Z63970)
NederlandsWerkvorm: College-practicum-opdracht
50 uren
Tweede semesterRombouts Lieve | Vleugels Rut | N. Inhoud
Hieronder staat een korte opsomming van de onderwerpen die aan bod komen in dit opleidingsonderdeel. Meer informatie vind je in de studiewijzer op Canvas.
Theorie
- Zuivering van DNA en RNA uit levende cellen
- Manipulatie van gezuiverd DNA
- Selectie met merkergenen en probes
- Verschillende types van kloneren en hun vectoren
- Aanmaken van een genenbibliotheek
- PCR : ontwerpen van PCR, q-PCR, digital dr oplet PCR, aantonen van merkers met PCR,...
- Sequencen : 1ste, 2de en 3de generatie
- Bestuderen van genexpressie en transcriptoom
- Identificatie van translatie product van een gecloond gen
- ...
Bio-informatica
- Oefeningen rond het opzoeken in DNA databanken
- primerontwerp
- off target locaties opsporen in een CRISPR Cas toepassing
- eiwitsequenties vergelijken in verschillende organismen
Labo
- Identificatie van een insert van een Fusarium schimmel in een zelf getransformeerde bacterie. Deze proef bestaat uit de volgende stappen :
- Isolatie fusarium DNA uit een besmette plant
- Kloneren van PCR product in TOPO vector
- Transformatie van E. coli cellen met recombinate TOPO vector
- Controle van de transformatie aan de hand van kolonie PCR
- Aantonen en kwantificeren van ggo's in veevoeders dmv Q-PCR .
- Crispr-Cas: homologe recombinatie in lacZ gen van E.coli
- Eiwitonderzoek: opsporen van genetische verwantschap van verschillende vissoorten en aantonen van een spiereiwit aan de hand van:
- SDS-PAGE
- Western blotting en immunodetectie
Studiemateriaal
ppt en cursus (theorie en labo)
Labster simulaties
Youtube filmpjes
DNA-databanken
Toelichting werkvorm
Theorie
De theorie wordt gedoceerd.
Studenten maken labster simulaties ter verduidelijking van de leerstof
Bio-informatica
Studenten werken individueel oefeningen uit in DNA databanken.
Labo
In het labo werken studenten per 2 aan de verschillende proeven.
Er wordt een rotatiesysteem voorzien.
De verschillende proeven lopen door elkaar, er wordt dus een zeer gedegen voorbereiding verwacht alvorens de student met de labo-opdracht start.
De student houdt alle resultaten bij in een laboschrift op de manier als aangegeven in de cursus.
Evaluatieactiviteiten
Gentechnologie (B-TM-Z95945)
Toelichting
| Examenmoment | Beoordelingsschaal |
|---|---|
| TOTAAL | 1-20/20 puntenschaal |
Het totaalpunt van dit OPO is de som van de onderdelen : "theorie" en "praktijk" gentechnologie. De praktijk bestaat uit een labo en bio-informatica opdrachten
In dit OPO zijn er delen die kunnen hernomen worden in de tweede zittijd en delen die niet hernomen kunnen worden in de tweede zittijd.
Theorie: 10/20 (50%)
Examenperiode juni: Schriftelijke toets over het onderdeel "theorie": 10/20
Een geslaagd punt wordt overgedragen naar tweede zittijd. Een niet geslaagd punt is herneembaar in tweede zit wanneer je niet geslaagd bent voor het gehele OPO.
Praktijk: 10/20 (50%)
Examenperiode juni: Schriftelijke toets over het onderdeel "labo en bio-informatica’’: 3/20 (15%)
Een geslaagd punt wordt overgedragen naar tweede zittijd. Een niet geslaagd punt is herneembaar in tweede zit wanneer je niet geslaagd bent voor het gehele OPO.
Permanente evaluatie: Observatie, laboschrift en opdrachten: 7/20 (35%).
Deze deelpunten worden overgedragen naar de 2de zittijd. Geen tweede examenkans mogelijk.
- Observatie cognitieve- en technische vaardigheden, organisatie, voorbereiding,... : 3/20 (15%)
- Laboschrift: 3/20 (15%)
- Opdrachten: 1/20 (5%)
Deelname aan de praktijksessies is noodzakelijk om de door de opleiding vooropgestelde leerdoelen correct en veilig te kunnen ontwikkelen en toetsen.
In elke praktijksessie is er een permanente evaluatie. Een student die een praktijksessie mist en niet kan inhalen, krijgt een 0 voor deze sessie.
Bij gewettigde afwezigheden kan de docent beslissen je wel of niet een vervangopdracht te geven.
Eindresultaat
Als op één van de twee bovenstaande onderdelen minder dan 6,0/20 of 6,0/20 wordt behaald, dan behaal je voor de totaliteit van het OPO nog maximaal 9,0/20. Niet elk leerdoel is van toepassing op de beide evaluatieactiviteiten. Bij een score die kleiner of gelijk is aan 6,0/20 op een onderdeel zijn er bijgevolg ook onvoldoende leerdoelen behaald om te slagen voor dit OPO.
Toelichting bij herkansen
Voor dit opleidingsonderdeel zijn er geen deeloverdrachten.
Het totaalpunt van dit OPO is de som van de onderdelen : "theorie" en "praktijk" gentechnologie. De praktijk bestaat uit een labo en bio informatica opdrachten.
In dit OPO zijn er delen die kunnen hernomen worden in de tweede zittijd en delen die niet hernomen kunnen worden in de tweede zittijd.
Er is een tweede examenkans voor de schriftelijke toets - van het theoriedeel (50%) en voor de schriftelijke toets van het praktijkdeel (15%).
De punten van de permanente evaluatie van het praktijkdeel (35%) blijven behouden en worden overgedragen naar tweede zittijd.
Theorie: 10/20 (50%)
Examenperiode juni: Schriftelijke toets over het onderdeel "theorie": 10/20
Een geslaagd punt wordt overgedragen naar tweede zittijd. Een niet geslaagd punt is herneembaar in tweede zit wanneer je niet geslaagd bent voor het gehele OPO.
Praktijk: 10/20 (50%)
Examenperiode juni: Schriftelijke toets over het onderdeel "labo en bio-informatica’’: 3/20 (15%)
Een geslaagd punt wordt overgedragen naar tweede zittijd. Een niet geslaagd punt is herneembaar in tweede zit wanneer je niet geslaagd bent voor het gehele OPO.
Permanente evaluatie: Observatie, laboschrift en opdrachten: 7/20 (35%).
Deze deelpunten worden overgedragen naar de 2de zittijd. Geen tweede examenkans mogelijk.
Eindresultaat
Als op één van de twee bovenstaande onderdelen minder dan 6,0/20 of 6,0/20 wordt behaald, dan behaal je voor de totaliteit van het OPO nog maximaal 9,0/20. Niet elk leerdoel is van toepassing op de beide evaluatieactiviteiten. Bij een score die kleiner of gelijk is aan 6,0/20 op een onderdeel zijn er bijgevolg ook onvoldoende leerdoelen behaald om te slagen voor dit OPO.